El Programa Monitoreo y Evaluación diseña, coordina, monitorea y realiza seguimiento y evaluación a la planeación del sistema. Asimismo, se constituye en un elemento fundamental para la autoevaluación y el autocontrol, permitiendo monitorear en tiempo real el quehacer de las estrategias y acciones de investigación y transferencia de la Universidad, al igual que el desempeño de cada uno de los programas que agregan valor al Sistema de Investigación, Transferencia e Innovación de la UPB.

La Evaluación por su lado es un proceso integral y continuo que ayuda a la investigación y análisis de cambios más o menos permanentes en el mediano y largo plazo, ocasionado de forma directa o indirecta por un programa, proyecto o proceso y los actores involucrados.

El programa ayuda a determinar exactamente cuándo un programa, proyecto o proceso está bien encaminado y cuándo es necesario introducir cambios; permite adquirir información y conocimiento necesario para la toma de decisiones sobre las operaciones programáticas del Sistema  y proporcionar datos necesarios para realizar la planificación estratégica,  diseñar e implementar programas y proyectos, y optimizar la asignación o reasignación de recursos.

Los Indicadores de Gestión son el principal parámetro para el ejercicio del control de la gestión  de este programa, lo cual se materializan de acuerdo a las necesidades, es decir con base en lo que se quiere medir, analizar, observar o corregir.  Es así como para este Programa generar la cultura de medición, no solo ayuda al cumplimiento de metas, sino al fortalecimiento de la competencia de orientación al logro que debe ser parte de todos los niveles  del Sistema de Investigación, transferencia e innovación de la Universidad.